武装部（保卫处）下设综合科、治安科、消防科、交通管理科、征兵军训科、军事教研室，系校征兵工作站、校园治安综合治理工作领导小组办公室、反恐怖防范工作领导小组办公室等机构的挂靠单位。
武装部（保卫处）在校党委直接领导下，主要负责校园安全监管，大学生军事训练、应征入伍、拥军优属，师生安全教育，治安、消防、交通的管理和服务，创建平安校园，维护校园安全稳定等工作。
部长：黄成茂
副部长：肖志斌
科室管理人员及办公电话
科室 | 职 务 | 姓名 | 办公电话 |
综合科 | 科 长 | 李龙仲 | 0591-83769557 |
治安科 | 副科长 | 沈志帮 | 0591-83752239 |
管理人员 | 吴永闽 | 0591-83789455 | |
消防科 | 科 长 | 徐清锋 | 0591-83710927 |
交通管理科 | 副科长 | 陆 语 | 0591-83722762 |
征兵军训科 | 科 长 | 童长寿 | 0591-83789356 |
| 副科级 | 汪春生 |
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全天候值班电话（校园“110”）福州仓山校区值班室：0591-83789110